2025-02-09 04:05:55
在PCR實(shí)驗(yàn)中,除了BsuDNAPolymerase,還有幾種聚合酶適合高溫?cái)U(kuò)增,包括:1.**TaqDNAPolymerase**:這是常用的PCR聚合酶,來(lái)源于Thermusaquaticus,能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性,可以承受PCR的熱變性步驟,且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**:來(lái)源于Pyrococcusfuriosus,具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性,提供校正功能,適用于對(duì)PCR保真性要求較高的實(shí)驗(yàn),如基因篩選、克隆表達(dá)、突變檢測(cè)、定點(diǎn)突變等。3.**VentDNAPolymerase**:來(lái)源于Litoralis棲熱球菌,具有3'→5'外切酶活性,可以去除錯(cuò)配的堿基,具有校對(duì)功能,保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍。4.**KODDNAPolymerase**:來(lái)自Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性比PfuDNAPolymerase更高,優(yōu)化后的PCR反應(yīng)緩沖液能使得其擴(kuò)增速度達(dá)到Taq酶的2倍、Pfu酶的5-6倍。5.**BstDNAPolymerase**:來(lái)源于Bacillusstearothermophilus,具有3'到5'外切割活性,適用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP技術(shù),可在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增,無(wú)需繁瑣的溫度循環(huán)。E1通常被認(rèn)為是泛素化過(guò)程中的限速步驟,因?yàn)樗婕暗椒核氐募て鸷虯TP的水解。Recombinant Mouse MXRA8 Protein,His Tag
在PCR實(shí)驗(yàn)中,防止非特異性擴(kuò)增的關(guān)鍵在于優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件和采取一些特定的策略。以下是一些有效的方法:1.**優(yōu)化引物設(shè)計(jì)**:引物設(shè)計(jì)是PCR成功的關(guān)鍵。應(yīng)確保引物序列具有高度特異性,避免與非目標(biāo)序列互補(bǔ)。使用在線(xiàn)工具進(jìn)行引物設(shè)計(jì),并進(jìn)行BLAST搜索以確認(rèn)特異性。2.**使用熱啟動(dòng)PCR**:熱啟動(dòng)PCR技術(shù)可以抑制室溫下的DNA聚合酶活性,減少非特異性擴(kuò)增。這種方法通過(guò)在高溫下激起酶的活性,從而在PCR體系配制階段降低引物與模板或引物與引物之間的非特異性結(jié)合。3.**調(diào)整Mg2+濃度**:Mg2+濃度對(duì)PCR擴(kuò)增的特異性和產(chǎn)量有重要影響。過(guò)高的Mg2+濃度可能導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增,因此需要優(yōu)化Mg2+濃度以獲得比較好的結(jié)果。4.**退火溫度優(yōu)化**:退火溫度對(duì)PCR特異性至關(guān)重要。較高的退火溫度有助于減少非特異性結(jié)合,但過(guò)高的退火溫度可能會(huì)降低引物與模板的結(jié)合效率。通常,退火溫度設(shè)置比引物的Tm值低5°C左右。5.**使用降落PCR**:降落PCR(TouchdownPCR)通過(guò)在初始循環(huán)中使用較高的退火溫度,然后逐漸降低退火溫度,從而在PCR開(kāi)始時(shí)減少非特異性擴(kuò)增,同時(shí)在后續(xù)循環(huán)中保持特異性擴(kuò)增。Recombinant Biotinylated Mouse IL-22 Protein,His-Avi TagRecombinant Biotinylated Human MAGE-A3 (HLA-A*24:02) Protein, His-Avi Tag 是一種通過(guò)重組DNA技術(shù)。
在比較BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶對(duì)于復(fù)雜DNA片段擴(kuò)增的適用性時(shí),以下是一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高熱穩(wěn)定性和擴(kuò)增效率而被應(yīng)用于常規(guī)PCR。它擴(kuò)增速度為30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,無(wú)校正功能,易產(chǎn)生錯(cuò)配堿基。-對(duì)于結(jié)構(gòu)復(fù)雜的模板,如GC含量高、有二級(jí)結(jié)構(gòu)等,TaqPlus可以用于擴(kuò)增,能有效地?cái)U(kuò)增10kb以下的片段。-有產(chǎn)品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通過(guò)基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具備更強(qiáng)大的擴(kuò)增性能,適合擴(kuò)增高度復(fù)雜的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高適溫度,能夠適應(yīng)更加苛刻的擴(kuò)增條件,同時(shí)消除DNA二級(jí)結(jié)構(gòu),因而能夠準(zhǔn)確并且均勻地?cái)U(kuò)增全基因組序列。-BstDNA聚合酶大片段能夠優(yōu)先擴(kuò)增短片段的DNA,并且能夠確保擴(kuò)增得到的DNA覆蓋了整個(gè)基因組,連貫并且無(wú)偏地?cái)U(kuò)增所有的遺傳位點(diǎn)。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,擴(kuò)增速度高達(dá)10秒/kb,擴(kuò)增目的片段長(zhǎng)達(dá)13kb,具有極強(qiáng)的擴(kuò)增效率的模板適應(yīng)性,非常適合復(fù)雜模板的高保真擴(kuò)增。
嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)和它的大片段(LargeFragment)是兩種在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中常用的酶。它們的主要區(qū)別在于結(jié)構(gòu)和活性:1.**結(jié)構(gòu)**:-完整的BstDNAPolymeraseI包含一個(gè)5'→3'的核酸外切酶活性區(qū)域,而大片段是通過(guò)基因工程改造或蛋白酶處理去掉了這個(gè)外切酶活性區(qū)域的酶。因此,大片段沒(méi)有5'→3'的核酸外切酶活性,但保留了5'→3'的DNA聚合酶活性。2.**活性**:-BstDNAPolymeraseI具有5'→3'的核酸外切酶活性,這意味著它在合成DNA的同時(shí)可以“校對(duì)”錯(cuò)誤,切除不匹配的核苷酸。而大片段由于缺少外切酶活性區(qū)域,不具有這種校對(duì)能力。-大片段具有更強(qiáng)的鏈置換能力,這使得它非常適合于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)和滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)。3.**應(yīng)用**:-BstDNAPolymeraseI由于具有校對(duì)功能,可能更適合于需要高保真度的DNA合成反應(yīng)。-BstDNAPolymerase,LargeFragment由于其鏈置換能力,更適合于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),這些技術(shù)不需要熱循環(huán)儀,可以在恒定溫度下進(jìn)行DNA擴(kuò)增。4.**熱穩(wěn)定性**:-BstDNAPolymerase,LargeFragment通常在65°C左右的溫度下進(jìn)行反應(yīng),而B(niǎo)stDNAPolymeraseI可能具有更寬的反應(yīng)溫度范圍。T4 DNA 聚合酶具有 5’→3’聚合酶活性,在模板及引物存在的條件下,能夠在結(jié)合有引物的單鏈 DNA 模板上。
BsuDNAPolymerase(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶)在PCR中的應(yīng)用具有多個(gè)優(yōu)勢(shì),以下是一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**鏈置換活性**:BsuDNAPolymerase具有很強(qiáng)的鏈置換活性,這使得它非常適合于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)。在這些技術(shù)中,BsuDNAPolymerase可以快速、高效、特異性地?cái)U(kuò)增模板,在10到30分鐘內(nèi)將痕量的核酸模板(低至單拷貝)擴(kuò)增至可以檢出的水平。2.**高溫穩(wěn)定性**:BsuDNAPolymerase在高溫下保持活性,這使得它在一些需要高溫反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)條件下表現(xiàn)出色。3.**高靈敏度和特異性**:BsuDNAPolymerase在等溫?cái)U(kuò)增中展現(xiàn)出高靈敏度,能夠?qū)⑽⒘亢怂崮0鍞U(kuò)增到可檢測(cè)水平。同時(shí),它也具有高特異性,減少了非特異性擴(kuò)增的風(fēng)險(xiǎn)。4.**簡(jiǎn)化的樣品處理**:BsuDNAPolymerase可以直接對(duì)復(fù)雜樣品進(jìn)行擴(kuò)增,無(wú)需事先進(jìn)行復(fù)雜的核酸純化和提取步驟,節(jié)省了時(shí)間和成本。5.**可擴(kuò)增DNA和RNA**:BsuDNAPolymerase不僅可以擴(kuò)增DNA,還可以直接擴(kuò)增RNA,省去了額外的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(cDNA合成)步驟,這對(duì)于RNA的檢測(cè)和分析更加方便快捷。6.**無(wú)核酸外切酶和RNase殘留**:BsuDNAPolymerase在生產(chǎn)過(guò)程中確保無(wú)核酸外切酶、切口酶及RNase殘留,這有助于提高實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。由于其高活性,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶允許從極少量的細(xì)胞中進(jìn)行實(shí)驗(yàn),如單細(xì)胞水平的研究。Recombinant Cynomolgus CD73/NT5E Protein,His Tag
One Step RT-qPCR SYBR Green Kit 是一種用于實(shí)時(shí)熒光定量PCR的試劑盒,它結(jié)合了反轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增步驟。Recombinant Mouse MXRA8 Protein,His Tag
磁珠法DNA凝膠回收試劑盒是一種用于從DNA瓊脂糖凝膠中回收特定DNA片段的實(shí)驗(yàn)室工具。與傳統(tǒng)的柱純化方法相比,磁珠法具有多個(gè)優(yōu)勢(shì):1.**操作簡(jiǎn)便快捷**:磁珠法DNA凝膠回收試劑盒的操作步驟通常包括凝膠的融化、DNA的結(jié)合、磁珠的洗滌和DNA的洗脫,整個(gè)過(guò)程可以在20分鐘內(nèi)完成。2.**高純度和高回收率**:磁珠法能夠穩(wěn)定、高效地從凝膠中回收DNA,純化所得的DNA可直接用于酶切、連接、轉(zhuǎn)化細(xì)菌、測(cè)序、PCR、雜交等后續(xù)操作。通?;厥章蔬_(dá)到60-80%,對(duì)于200bp以下小片段和10kb以上大片段的回收率有所下降。3.**適用性廣**:適用于100bp以上DNA片段的純化,對(duì)達(dá)到10kb片段DNA的純化也能保持較好的效果。4.****性高**:操作過(guò)程中不涉及酚/氯仿等有毒試劑,更加環(huán)保和**。5.**靈活性**:可以根據(jù)實(shí)際狀況靈活調(diào)節(jié)磁珠用量,適應(yīng)不同體積和濃度的樣品處理。6.**自動(dòng)化和高通量**:磁珠法純化試劑盒適合手工操作,也可用于自動(dòng)化工作站或核酸自動(dòng)提取儀,實(shí)現(xiàn)高通量操作。Recombinant Mouse MXRA8 Protein,His Tag